根據(jù)《中國（福建）自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)總體方案》，福建自貿(mào)區(qū)被賦予六大主要任務(wù)，共16項(xiàng)措施。總體方案全文大約一萬字，其中第三部分的主要任務(wù)和措施的總字?jǐn)?shù)約8000字。

　　一、轉(zhuǎn)變政府職能下放權(quán)限

　　總體方案提出，將深化行政管理體制改革，加快推進(jìn)政府管理模式創(chuàng)新，福建省能夠下放的經(jīng)濟(jì)社會管理權(quán)限，全部下放給自貿(mào)區(qū)。并將原由政府部門承擔(dān)的資產(chǎn)評估、鑒定、咨詢、認(rèn)證、檢驗(yàn)檢測等職能逐步交由法律、會計(jì)、信用、檢驗(yàn)檢測認(rèn)證等專業(yè)服務(wù)機(jī)構(gòu)承擔(dān)。

　　二、兩方面改革投資管理體制

　　A.改革外商投資管理模式。探索對外商投資實(shí)行準(zhǔn)入前國民待遇加負(fù)面清單管理模式，對負(fù)面清單之外領(lǐng)域，按照內(nèi)外資一致原則，外商投資項(xiàng)目實(shí)行備案制（國務(wù)院規(guī)定對國內(nèi)投資項(xiàng)目保留核準(zhǔn)的除外），由福建省辦理。

　　實(shí)施自貿(mào)區(qū)外商投資負(fù)面清單制度，減少和取消對外商投資準(zhǔn)入限制。先行選擇航運(yùn)服務(wù)、商貿(mào)服務(wù)、專業(yè)服務(wù)、文化服務(wù)、社會服務(wù)及先進(jìn)制造業(yè)等領(lǐng)域擴(kuò)大對外開放，積極有效吸引外資。

　　B.對一般境外投資項(xiàng)目和設(shè)立企業(yè)實(shí)行備案制。

　　三、支持開展汽車平行進(jìn)口試點(diǎn)

　　A.支持開展汽車平行進(jìn)口試點(diǎn)。允許在海關(guān)特殊監(jiān)管區(qū)內(nèi)設(shè)立保稅展示交易平臺。符合條件的地區(qū)可按政策規(guī)定申請實(shí)施境外旅客購物離境退稅政策。允許境內(nèi)期貨交易所開展期貨保稅交割試點(diǎn)。推進(jìn)動漫創(chuàng)意、信息管理、數(shù)據(jù)處理、供應(yīng)鏈管理、飛機(jī)及零部件維修等服務(wù)外包業(yè)務(wù)發(fā)展。

　　B.提升航運(yùn)服務(wù)功能，允許設(shè)立外商獨(dú)資國際船舶管理企業(yè)。允許外商以合資、合作形式從事公共國際船舶代理業(yè)務(wù)，外方持股比例放寬至51%。允許試點(diǎn)海運(yùn)快件國際和臺港澳中轉(zhuǎn)集拼業(yè)務(wù)。允許在自貿(mào)區(qū)內(nèi)注冊的大陸資本郵輪企業(yè)所屬的“方便旗”郵輪，經(jīng)批準(zhǔn)從事兩岸四地郵輪運(yùn)輸。

　　C.推進(jìn)通關(guān)機(jī)制創(chuàng)新。建設(shè)國際貿(mào)易“單一窗口”，全程實(shí)施無紙化通關(guān)。試行企業(yè)自主報(bào)稅、自助通關(guān)、自助審放、重點(diǎn)稽核的通關(guān)征管作業(yè)。

　　四、金融企業(yè)結(jié)匯政策放寬

　　A.擴(kuò)大金融對外開放。符合條件的自貿(mào)區(qū)內(nèi)機(jī)構(gòu)在限額內(nèi)自主開展直接投資、并購、債務(wù)工具、金融類投資等交易。深化外匯管理改革，將直接投資外匯登記下放銀行辦理，外商直接投資項(xiàng)下外匯資本金可意愿結(jié)匯，進(jìn)一步提高對外放款比例。允許自貿(mào)區(qū)內(nèi)企業(yè)、銀行從境外借入本外幣資金，企業(yè)借入的外幣資金可結(jié)匯使用。放寬自貿(mào)區(qū)內(nèi)法人金融機(jī)構(gòu)和企業(yè)在境外發(fā)行人民幣和外幣債券的審批和規(guī)模限制。

　　B.拓展金融服務(wù)功能。推進(jìn)利率市場化，允許符合條件的金融機(jī)構(gòu)試點(diǎn)發(fā)行企業(yè)和個(gè)人大額可轉(zhuǎn)讓存單。在加強(qiáng)有效監(jiān)管前提下，允許符合條件的中資銀行試點(diǎn)開辦外幣離岸業(yè)務(wù)。支持自貿(mào)區(qū)內(nèi)法人銀行按有關(guān)規(guī)定開展資產(chǎn)證券化業(yè)務(wù)。在合法合規(guī)、風(fēng)險(xiǎn)可控前提下，逐步開展商品場外衍生品交易。支持廈門兩岸區(qū)域性金融服務(wù)中心建設(shè)。

　　五、建設(shè)平潭國際旅游島

　　建設(shè)國際旅游島，研究推動平潭實(shí)施部分國家旅游團(tuán)入境免簽政策，對臺灣居民實(shí)施更加便利的入出境制度。